Sélection génomique

Qu’est-ce que la sélection génomique ?

La génomique est le séquençage et l’analyse du génome d’un organisme (son ADN). L’analyse des phénotypes (des caractéristiques que nous pouvons voir et mesurer, telles que le poids corporel) et des données génomiques (l’ADN provenant des individus) nous permet de procéder à une sélection plus précise des caractéristiques souhaitées et d'en obtenir une amélioration plus rapide. La sélection génomique peut s’avérer bien plus efficace que les technologies de sélection animale conventionnelles, notamment pour les caractères mesurés en fin de vie ou difficiles à quantifier. Les valeurs de sélection génomique, qui sont basées sur un modèle unique de marqueurs ADN, permettent de prédire avec une grande précision les gènes intéressants pour la sélection. Les informations basées sur l’ADN seront l’élément moteur du processus visant à améliorer encore davantage les reproducteurs en fonction des exigences spécifiques des clients.

Avantages du programme de sélection sur le plan génétique

Nous sommes convaincus que l’utilisation de la génomique nous permettra de surmonter les défis que nous n’avons pas pu relever auparavant et d’améliorer notre programme de sélection conventionnelle. La sélection génomique est bien plus efficace pour les caractéristiques à faible hérédité, les caractéristiques sexuelles ou celles ne pouvant être mesurées qu’à l’abattoir. D’autres caractéristiques potentielles, comme par exemple les anomalies génétiques, la mortalité et autres caractéristiques de santé, peuvent également être mesurées. Grâce à une meilleure estimation du potentiel génétique des candidats à la sélection, le taux de gain génétique augmentera considérablement.

La sélection animale peut se révéler être un procédé exigeant compte tenu des besoins variables et complexes de la chaîne de valeur. Pour sélectionner correctement ce qui doit être transmis (ou non) dans la lignée génétique, il faut une action résolue sur la durée et comprendre les besoins à long terme des clients . La sélection génomique permet de profiter dès le départ d’une précision significativement accrue.

SNP – la base de la sélection génomique

Le séquençage du génome un procédé de laboratoire qui détermine la séquence ADN complète du génome d’un organisme. Avec le séquençage génomique, la bibliothèque complète des paires de bases d’un animal est cartographiée. Une petite part peut être classifiée en tant que « polymorphismes d’un seul nucléotide » (SNP) ; une situation où les bases nucléiques en un point donné du génome sont de types différents chez certains individus d’une même espèce. Il y a plusieurs millions de SNP connus dans le génome des animaux. Ces SNP servent de base à la sélection génomique. À travers cette technologie, un grand nombre de SNP sont sélectionnés dans le génome pour servir de source d’informations pour l’estimation de la valeur génétique. Hendrix Genetics lie les différences dans ces marqueurs aux différences de performances observées dans son panel d’animaux de référence et offre ainsi une occasion unique de calculer la valeur de sélection génomique. 

Ces marqueurs permettent de mesurer plus précisément le mérite génétique, car la plupart des caractéristiques sont influencées par un grand nombre de gènes à petits effets. Ces informations génomiques sont également utilisées pour estimer les relations entre animaux, nous permettant ainsi d’exploiter au mieux les informations familiales. Les effets des marqueurs sont ensuite utilisés pour prédire le mérite génétique des animaux n’ayant aucun phénotype précis, mais qui sont génotypés pour les marqueurs SNP. 

Applications au sein de chaque espèce

Cette avancée technologique concerne de nombreuses espèces et s'inscrit dans la continuité des objectifs que s’est fixé Hendrix Genetics : Better Breeding Today for a Brighter Life Tomorrow (une sélection plus performante aujourd'hui, pour une vie meilleure demain). La frise chronologique ci-dessous indique l’année d’introduction de la sélection génomique dans le programme de sélection pour chaque espèce.

La sélection génomique offre de nombreux avantages, comme une plus grande précision, une rapidité accrue, des connaissances approfondies et une meilleure compréhension de l’ADN de l’animal. Cette nouvelle technologie est en phase avec notre engagement consistant à fournir une chaîne de valeur de protéines animales avec des solutions génétiques innovantes et durables.